Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RNF40O75150 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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RNF40O75150 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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RNF40O75150 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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RNF40O75150 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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RNF40O75150 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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RNF40O75150 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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RNF40O75150 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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RNF40O75150 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RNF40O75150 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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