Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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FOXQ1Q9C009 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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FOXQ1Q9C009 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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