Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CDKN3Q16667 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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