Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
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SKIV2LQ15477 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
SKIV2LQ15477 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
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