Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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COL4A6Q14031 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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COL4A6Q14031 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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COL4A6Q14031 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL4A6Q14031 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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