Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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PRPF4BQ13523 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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PRPF4BQ13523 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PRPF4BQ13523 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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PRPF4BQ13523 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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PRPF4BQ13523 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PRPF4BQ13523 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PRPF4BQ13523 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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