Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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TCOF1Q13428 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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TCOF1Q13428 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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TCOF1Q13428 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TCOF1Q13428 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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