Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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ITGB3BPQ13352 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
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ITGB3BPQ13352 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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ITGB3BPQ13352 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ITGB3BPQ13352 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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