Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SP140Q13342 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SP140Q13342 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SP140Q13342 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SP140Q13342 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SP140Q13342 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SP140Q13342 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SP140Q13342 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SP140Q13342 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SP140Q13342 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SP140Q13342 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SP140Q13342 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SP140Q13342 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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SP140Q13342 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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