Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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FOXD4Q12950 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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FOXD4Q12950 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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FOXD4Q12950 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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FOXD4Q12950 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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