Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CENPFP49454 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CENPFP49454 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CENPFP49454 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CENPFP49454 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CENPFP49454 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CENPFP49454 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CENPFP49454 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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CENPFP49454 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CENPFP49454 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CENPFP49454 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CENPFP49454 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CENPFP49454 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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