Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.9 ms