Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NEDD1Q8NHV4 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms