Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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