Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PRPF4BQ13523 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms