Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms