Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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TRAF1Q13077 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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