Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
MCCD1P59942 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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