Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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