Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CENPFP49454 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CENPFP49454 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CENPFP49454 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CENPFP49454 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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CENPFP49454 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
CENPFP49454 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
CENPFP49454 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
CENPFP49454 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CENPFP49454 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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