Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PRKCHP24723 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms