Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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