Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms