Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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