Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
BBS9Q3SYG4 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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