Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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RTL8BQ17RB0 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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RTL8BQ17RB0 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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RTL8BQ17RB0 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RTL8BQ17RB0 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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