Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NRF1Q16656 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms