Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HMGN3Q15651 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms