Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SYCP1Q15431 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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