Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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PDCD1Q15116 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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