Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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