Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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NCOA4Q13772 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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NCOA4Q13772 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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NCOA4Q13772 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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NCOA4Q13772 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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NCOA4Q13772 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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NCOA4Q13772 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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NCOA4Q13772 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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NCOA4Q13772 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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NCOA4Q13772 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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NCOA4Q13772 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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NCOA4Q13772 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NCOA4Q13772 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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