Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NME3Q13232 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NME3Q13232 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NME3Q13232 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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