Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms