Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPRCP08575 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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