Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RN7SL685P-201ENST00000476271 298 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL132855.1-201ENST00000557368 207 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC104046.1-201ENST00000559487 406 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC139085.1-201ENST00000582716 182 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 HIGD1B-205ENST00000591513 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SLC6A21P-201ENST00000599458 369 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC245033.3-201ENST00000617986 224 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LINC00934-202ENST00000630357 2291 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CCL28-201ENST00000361115 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CPB2-AS1-204ENST00000606991 3218 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL008638.2-201ENST00000453934 2383 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 KAT14-206ENST00000489634 3152 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ARMC3-202ENST00000376528 3258 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CLUHP5-201ENST00000438421 774 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC087269.1-201ENST00000522213 666 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC004224.2-201ENST00000574423 529 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC244517.10-201ENST00000624396 548 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL136967.1-201ENST00000625120 441 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 OR52K3P-202ENST00000641797 1729 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ADA2-202ENST00000330232 3195 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SNPHO15079 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms