Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FSCN1Q16658 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms