Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms