Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PSMD6Q15008 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms