Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CACNA1SQ13698 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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