Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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SF3B2Q13435 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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SF3B2Q13435 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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SF3B2Q13435 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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