Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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