Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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