Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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