Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXO1Q12778 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms