Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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PTPRMP28827 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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PTPRMP28827 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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PTPRMP28827 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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PTPRMP28827 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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PTPRMP28827 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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PTPRMP28827 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
PTPRMP28827 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
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