Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms