Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CSPP1Q1MSJ5 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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