Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms