Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PDCD1Q15116 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms